Brooklyn Evolution Startup Melonfrost, Daha Fazla Mikrop Üretmek İçin 7 Milyon Dolar Topladı

Sam Levin'in büyükbabası, Batı Massachusetts'te beşinci nesil bir patates çiftçisiydi ve Midwest'teki endüstriyel çiftliklerden düşen patates fiyatlarıyla rekabet etmeye çalışıyor. Bir dizi başka mahsul yetiştirmeye çalıştıktan sonra, Porto Riko'dan kaçırılan bir dizi kavun tohumu, bölgenin kumlu tınlı topraklarında gelişerek işe yaramış gibi görünüyordu. Bu kavunlar, bir don gelip mahsulü öldürene kadar hasat için neredeyse olgunlaşmıştı - aile efsanesi böyle devam ediyor.

Levin şimdi, evrimi otomatik bir kapalı döngüde yönlendirmek için tescilli yazılımını ve donanımını birleştiren, Brooklyn merkezli bir evrim başlangıcı olan Melonfrost'un CEO'su ve kurucu ortağıdır. Teknoloji, gıda ve enerjiden terapötik maddelere ve sentetik malzemelere kadar her şey için yeni mikroplar tasarlamak ve üretmek için yeni bir yöntem sağlamayı amaçlıyor - bunların tümü geleceği tasarlamanın veya inşa etmenin değil, geleceğin inşa edilmesinin bir parçası. büyüyen BT. "Bizim için mesele, artık don gibi felaketlerin tamamen kaprisine kapılmamak, mecazi olarak, istenen kullanım ne olursa olsun dona dayanıklı kavunlar yapabilmekle ilgili," diye açıklıyor.

Arzu edilen kullanımlar için belirli özelliklere sahip mikropları büyütmek için çeşitli araçlar, tarihsel olarak ölçeklendirme yeteneği ile sınırlandırılmıştır - düzenlenmiş bir türden ticarileştirilmiş bir türe geçişte bir darboğaz yaratmaktadır - bunu yapmak için birçok yöntem nispeten pahalı ve biraz kaba kuvvet tahminine dayanmaktadır. -ve-kontrol yaklaşımları tipik olarak bir genetik dizideki mutasyonlara dayalıdır. Bunun yerine, Melonfrost'un Refactor Capital ve Alexandria Venture Investments tarafından yönetilen son 7 milyon dolarlık tohum turu, Levin'in ifadesiyle "evrimin uzun bir süre organizmaların en iyi tasarımcısı olduğu ve olmaya devam edeceği" tezini destekliyor.

Fenotip seçimine odaklanmanın merkezinde Melonfrost'un Evolution Reactor donanımı ve tescilli yazılım platformu Maia yer alır. Maia, ölçülen fenotiplerle ilgili oldukları için farklı seçim baskılarına ve çevresel koşullara göre organizmaların nasıl geliştiğini öğrenen ve istenen bir evrimleşmeye devam etmek için daha fazla seçim baskısı şeklinde yinelemeli bir dizi talimat döndüren bir makine öğrenimi algoritmaları paketidir. Verim veya donma direnci olsun, bir dizi özellik. Bu girdi ve çıktı verileri, Maia'yı, paralel evrim yörüngelerinde binlerce bağımsız mikrobiyal popülasyon yetiştirmek için bu kodlanmış seçilim baskılarını bireysel olarak kontrol etmek, ölçmek ve uygulamak için kullanılan aparat olan Evrim Reaktörüne bağlar.

Evrimi geniş ölçekte yönlendirmek, her biri yaklaşık 250 ayrı mikrobiyal popülasyonu barındıran Evrim Reaktörü'ndeki bir dizi modüler ünitede kapsüllenmiş bir dizi donanım yeniliği ile mümkün kılındı. Sanal ve mekanik olmak üzere iki platform, otomatik evrim yönlendirme platformunun döngüsünü kapatan bulut yazılımı tarafından birbirine örülmüştür - yazılıma beslenen donanım tarafından ölçülen veriler, modelleme yazılımı güncellemeleriyle donanıma geri iletilen talimatlar - istenen fenotipik olana kadar yinelenen hedefe ulaşılır veya döngü kapatılır. Şu anda tüm sistem Melonfrost'un Brooklyn laboratuvar alanına sığıyor, ancak Levin bu donanım-yazılım arabiriminin vizyonunu bir Evolution Reactor deposu biçiminde bir "biyolojik veri merkezi" olarak ifade ediyor.

Bu tohum turu, bu evrimsel yönlendirme sisteminin tam biçimine doğru atılan bir sonraki adımdır - Evolution Reactor donanımını inşa etmenin bir sonraki aşamasını finanse etmek ve Melonfrost'u gıda sektörünün yenilebilir yağlar alanındaki ilk müşterisine taşımak. Levin, "Dünyayı süreç içinde yok etmeden beslemek, özellikle ilk oluşumdan üretime geçişte pek çok darboğazın olduğu bir sentetik biyoloji alanıdır" diye vurguluyor Levin. Gıda yoluyla daha sağlıklı bir dünya inşa etmeye odaklanmak, Levin ve onun kurucu ortağı, Mühendislik ve Tasarım Başkanı ve çocukluk arkadaşı Loren Amdahl-Culleton için yeni değil. İkili, lisede öğrenim topluluğuna öğrenci yatırımını artırmak ve sürdürülebilirliğe doğru ilerlemek için kafeteryalarında bir çiftlik kurdu. Lisans ve lisansüstü okul yıllarını bir okyanus ve bütün bir ülkeyle birbirinden ayırarak geçirmelerine rağmen ikisi, Oxford'dan Stanford'a sırasıyla evrimsel dinamikler ve pekiştirmeli öğrenim üzerinde çalışırken iletişimlerini sürdürdüler ve evrimsel modellerdeki boşlukları makineyle doldurma potansiyelini fark etmeye başladılar. temel matematiğinde benzerlikler verilen öğrenme araçları. Diğer iki çocukluk arkadaşıyla birlikte Melonfrost doğdu - son teknoloji makine öğrenimi ve donanım mühendisliğinden sentetik biyolojiye ve hassas özel yazılım araçlarına kadar farklı alanlarda sentez yaparak olumlu etki yaratma güdüsüyle.

Levin, "Bu çabalardan herhangi biri çok fazla uzmanlık, başarısızlık ve yenilik gerektirecektir, bu nedenle bunların hepsini aynı anda yapmak biraz sıra dışıdır," diye itiraf ediyor Levin, "ancak bu zorluklar o kadar büyük ki yenilik yapmanız gerekiyor. geleceği gerçekten büyütmek için çok farklı türden bilim insanlarını ve mühendisleri entegre edin. Bu sadece pazara yeni moleküller veya kimyasallar getirmeyi amaçlamakla ilgili değil; bunun yerine, dünya kaynaklarının oluşma ve hareket etme şeklini temelden değiştirmemiz gerekiyor.” Melonfrost için amaç, sonunda büyük fabrikalar inşa etmek ve kargo konteynırlarında nakliye yapmak değil. Bunun yerine vizyon, mecazi don ne zaman gelirse gelsin, yeni türleri hızlı, ucuz ve sağlam bir şekilde imal etmek ve optimize etmektir - evrim dilini öğrenmekten ölçekli güvenilir biyolojik çıktılara çevirmek için genel olarak üretime yaymak.

Bu makale hakkında ek araştırma ve raporlama için Aishani Aatresh'e teşekkür ederiz. SynBioBeta'nın kurucusuyum ve hakkında yazdığım şirketlerden bazıları, SynBioBeta'nın sponsorları. SynBioBeta konferansı ve haftalık özet.